La cittadella di Machu Picchu può essere visitata da sola, ma è anche possibile visitare Wayna Picchu (chiamata anche Huaynapicchu) o Machu Mountain. Questi due siti sono le montagne ai lati di Machu Picchu e l'accesso avviene da Machu Picchu, cioè è necessario passare il controllo d'ingresso di Machu Picchu per accedere a questi siti. Per questo motivo, è impossibile acquistare un biglietto separato per Wayna Picchu o Machu Mountain senza Machu Picchu. Questi due siti possono essere visitati solo al mattino.
Wayna Picchu, che significa Montagna Giovane in quechua, è la montagna più piccola. La salita dura circa 1 ora e la discesa altrettanto, per un totale di 2 ore di visita. Il percorso è segnalato e l'accesso è aperto a tutti, anche ai bambini. Si consiglia di salire se si desidera avere una vista mozzafiato sull'intera cittadella di Machu Picchu. A volte, soprattutto in inverno (da dicembre a febbraio), la nebbia impedisce una buona visuale, ma spesso si dissolve rapidamente.
Machu Mountain, che significa Montagna Vecchia, è la montagna più grande, che si trova di fronte a Wayna Picchu. La salita dura 2 ore e altrettanto per la discesa, per un totale di 4 ore di visita. Anche in questo caso, il percorso è segnalato e l'accesso è relativamente facile, anche se alcune aree possono essere difficili a causa dei gradini. Tuttavia, l'accesso è completamente sicuro e richiede solo un buon paio di scarpe. Non è necessario essere sportivi o particolarmente preparati, ma la salita può essere faticosa, soprattutto considerando che la visita dura 4 ore in totale. Se la vista da Wayna Picchu è impressionante, quella da Machu Mountain è davvero favolosa.
È fisicamente e tecnicamente impossibile visitare entrambi i siti lo stesso giorno, quindi è necessario sceglierne uno. Prima di tutto, bisogna tenere presente che un biglietto per Machu Picchu con o senza un sito aggiuntivo è valido per un massimo di 6 ore, anche se in pratica le autorità accettano che i visitatori rimangano un po' più a lungo. Questo significa che se si sceglie di visitare Wayna Picchu, si avranno circa 2 ore per visitare questo sito e 4 ore per visitare Machu Picchu. Questi sono tempi normali e si apprezzeranno entrambi i siti senza stress. Se si sceglie di visitare Machu Mountain, si avranno 4 ore per visitare Machu Picchu. Queste restrizioni sono un fattore da considerare quando si sceglie tra i due: scegliete Wayna Picchu se volete avere abbastanza tempo per esplorare Machu Picchu lo stesso giorno.
Se preferite la vista panoramica, scegliete Machu Mountain. Inoltre, se volete visitare Machu Picchu come una sfida. Se avete bambini piccoli, se volete visitare Machu Picchu per almeno 2 ore lo stesso giorno o se non avete la forza di salire le scale per 4 ore, scegliete Wayna Picchu.
Infine, molte persone preferiscono soggiornare 2 giorni ad Aguas Calientes per visitare un sito il primo giorno e l'altro il secondo giorno, e la maggior parte è pienamente soddisfatta della visita tranquilla della sola cittadella di Machu Picchu. Le famose foto di Machu Picchu nella sua interezza vengono scattate precisamente dalla casa del guardiano in cima a Machu Picchu.